土壤与农业可持续发展国家重点实验室系列学术报告
题 目:第三代测序技术 ——基于单分子的实时测序技术、应用及展望
The 3rd Generation Sequencing Technology from Pacific Biosciences
– Applications of single molecule real time sequencing technology in microbial genomics unravel new insight
报告人:钱 祖卫博士
美国太平洋生物技术公司(Pacific Biosciences)
时 间:2012年11月20日上午9:00
地 点:惠联大楼第一报告厅(或大礼堂)
报告人简介:
毕业于复旦大学生物系。后赴美留学并于1994年获New Jersey Medical School 分子生物学博士。 1994–1997 任Life Sciences Research Foundation Fellow在著名的Howard Hughes Medical Institute 霍华德休斯医学研究所从事生物钟信号分子传导机制的博士后研究。从1997至2000年先后在AlphaGene Inc.和Genome Therapeutics Corp 以资深科学家和课题组长的身份从事基因芯片的开发和利用。从2000–2005 年受聘于Affymetrix 从事GeneChip 产品系列的研发和应用。2006-2008任Affymetrix在中国代表处的科学事务与合作副总监。2008-2010任Affymetrix亚太区技术支持副总监。自2010九月起就职于美国太平洋生物技术公司(Pacific Biosciences)。 现任该公司亚太区科学事务专员。
报告简介:
每克土壤中微生物数量通常高于10亿,然而,土壤中绝大多数绝大多数微生物的功能和代谢多样性未知。2011年4月,美国太平洋生物技术公司PacBio率先研发出一种可靠的基于单分子的实时测序技术,规避了传统测序的扩增过程,推出了全新的三代测序技术,革命性地变革了现有的二代高通量测序技术,为全面理解“已知的”和“未知的”环境微生物,特别是土壤中数量巨大的难培养微生物提供了一种高效廉价的全新技术平台。PacBio单分子实时测序技术是目前唯一的能够通过单一测序同时完成多目标实验的技术平台,如微生物基因组测序、结构预测、甲基化分析和菌株鉴别的整合分析。
本报告将重点介绍如下内容:(1)PacBio单分子实时测序拥有世界领先水平的读长优势,及其在微生物基因组拼接方面的优势;(2)PacBio实时动态的测序信息如何用于DNA碱基修饰如甲基化过程;(3)基于DNA甲基化信息的微生物致病机理分析,以及目前PacBio单分子测序技术拥有的不可替代优势;(4)PacBio单分子测序技术的最新研究论文实例。